PEM Akamigas menyediakan fasilitas kesehatan berupa Poliklinik yang berlokasi di kampus PEM Akamigas, Jalan Gajah Mada no. 38 Cepu. Poliklinik PEM Akamigas memberikan layanan kesehatan rutin kepada mahasiswa untuk kategori sakit ringan. Fasilitas layanan yang disediakan adalah Poli Umum dan Poli Gigi. Poliklinik PEM Akamigas mengadakan kerja sama dengan RS PKU Muhammadiyah untuk layanan rujukan. Di masa pandemi ini, PEM Akamigas juga menyediakan layanan GeNose dan Rapid Test